三重四极气质联用仪适用于挥发和半挥发性有机化合物的定性定量研究。并能对目标化合物进行高灵敏度、高选择性的筛查和对微量化合物的准确定量分析。
环境保护科学中，可用于大气、水及土壤中有机污染物的定性定量分析。
食品和药品检测中，可用于农药残留等有毒有害物质的定性定量分析。
在生物化学、医药化学、法医化学、毒物化学、兴奋剂检测和未知样品剖析等方面也有广泛应用。
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